2024-2025 / Master

Bioinformatique et modélisation, à finalité approfondie

120 crédits

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Bloc 1

Choix du programme

En accord avec le Jury, choisir un des deux programmes en fonction du parcours de l'étudiant :

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits

Programme réformé

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Uniquement accessible aux étudiants qui entament leur parcours de master ou l'ont entamé en 2023-2024 ou qui viennent d'acquérir les crédits du bloc 0.
BIOC0726-1Boîte à Outils : Techniques d'analyse des acides nucléiques - [4h Autres] Q12412[+]3
BIOC0727-1Boîte à Outils : Imagerie et modèles expérimentaux - [14h Autres] Q1224[+]3
BIOC0728-1Boîte à Outils : Techniques d'analyse des protéines - [20h Autres] Q120-[+]3
BIOC0729-1Adaptation, Evolution et Diversité - [30h Autres] Q1406[+]5
BIOC0730-1Développement, de la cellule à l'organisme - [16h Autres] Q16818[+]7
BIOC0731-1Réponses à l'environnement - [20h Autres] Q14020[+]5
BIOC0732-1Interactions entre organismes - [16h Autres] Q13616[+]5
BIOC0733-1Boîte à outils : Biologie structurale - [5h Autres] Q22015[+]3
BIOC0734-1Métabolisme - [30h Autres] Q24010[+]5
BIOC0735-1Biotechnologies - [15h Autres] Q25445[+]7
BIOC0736-1
Stratégies biomédicales - [24h Autres] Q2368[+]5
INFO0960-1Command-line interfaces and tools for biologists (anglais) Q21010-2
SSTG0068-1Stage en laboratoire - [5sem Stages] Q2--[+]7

Ancien programme

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Uniquement accessible aux étudiants inscrits au master avant l'année académique 2023-2024.
BIOC0709-4Bioénergétique Q120--3
BIOC0210-5Enzymologie - [10h Travaux dirigés] Q120-[+]3
BIOC0720-1Biologie structurale - [15h Travaux dirigés] Q125-[+]4
BIOC0721-1Spectroscopies optiques pour la biochimie Q115--2
GENE0001-4Génie génétique Q120--3
GENE0432-4Evolution génétique et biochimique Q130--3
GENE0003-1Génomique Q220--3
BIOL0008-1Bioinformatique - [5h Travaux dirigés] Q120-[+]3
BIOL0021-1Biologie des systèmes - [10h Travaux dirigés] Q110-[+]2
SSTG0009-1Stages ou travaux pratiques intégrés (y compris séminaires) - [8sem Stages] TA--[+]12

En accord avec le Jury, choisir une option parmi :

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Biochimie

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Remarque : Uniquement accessible aux étudiants ayant choisi cette option avant l'année académique 2019-2020.

Génétique

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Remarque : Uniquement accessible aux étudiants ayant choisi cette option avant l'année académique 2019-2020.

Physiologie et biologie du développement

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Remarque : Uniquement accessible aux étudiants ayant choisi cette option avant l'année académique 2019-2020.

Microbiologie et immunologie

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Remarque : Uniquement accessible aux étudiants ayant choisi cette option avant l'année académique 2019-2020.

Biochimie et microbiologie

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Remarque : Uniquement accessible aux étudiants ayant choisi cette option avant l'année académique 2021-2022.
BIOC0723-1Bioénergétique appliquée Q215--2
BIOC0722-1Application de techniques spectroscopiques à l'étude du repliement et de la stabilité des protéines - [10h Travaux dirigés] Q220-[+]3
CHIM0688-1Spectrométrie de masse biologique - [5h Travaux dirigés] Q215-[+]2
BIOC0003-2Biochimie et physiologie des microorganismes Q215--2
BIOL0013-1Développement des microorganismes - [5h Travaux dirigés] Q215-[+]2
MICR1713-1Microorganismes extrémophiles - [5h Travaux dirigés] Q210-[+]2
MICR0004-1Pathogenèse bactérienne
N...
Q215--2
MICR0005-1Protistologie Q215--2
MICR0006-1Virologie, immunologie et vaccinologie Q225--3
CHIM0059-6Microbiologie industrielle
Q220--2

Génétique, physiologie et biologie du développement

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
Remarque : Uniquement accessible aux étudiants ayant choisi cette option avant l'année académique 2021-2022.
GENE0445-1Génétique quantitative - [15h Travaux dirigés] Q215-[+]3
GENE0441-2Génétique extrachromosomique, Partim A Q215--2
BIOL0009-1Physiologie moléculaire et cellulaire et voies de signalisation animales Q225--3
BIOL0010-1Physiologie moléculaire et cellulaire et voies de signalisation végétales Q220--3
BIOL0011-1Biologie du développement animal Q225--3
BIOL0012-1Biologie du développement végétal Q225--3
BIOL0032-1Biologie évolutive du développement Q215--2
BIOL0014-1Imagerie moléculaire dynamique Q220--3

BIM - specific option

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
INFO0956-1Introduction to biological data analysis (anglais) - [20h Travaux dirigés] Q15-[+]3
INFO0009-2Bases de données (organisation générale) - [25h Projet] Q22626[+]5
INFO0960-1Command-line interfaces and tools for biologists (anglais) Q21010-2
BIOL0022-2Introduction à la propriété intellectuelle - [10h Travaux dirigés] Q210-[+]2
BIOL0014-1Imagerie moléculaire dynamique Q220--3
INFO0961-1Introduction à la bioautomatique et à l'analyse d'images - [12h Projet] Q21216[+]4
INFO0959-1Bioinformatics applications: Technological survey (anglais) - [40h Projet]
Q2--[+]3

Cours facultatifs

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
AESS0320-1Initiation à la didactique de la biologie Q22020-3
INFO0961-1Introduction à la bioautomatique et à l'analyse d'images - [12h Projet] Q21216[+]4

Bloc 2

Cours obligatoires de la finalité

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
BIOL0033-1Du laboratoire à l'entreprise - [20h Autres] Q120-[+]2
BIOL0034-1Ecriture scientifique - [20h Autres] Q116-[+]2
BIOL0029-1Practical genomics (anglais) - [30h Travaux dirigés] Q110-[+]4
INFO0962-1Scripting interface for biological software (anglais) - [40h Travaux dirigés] Q110-[+]6
INFO0963-1Design and use of biological databases (anglais) - [40h Travaux dirigés] Q110-[+]3
INFO0954-1Advanced biological data analysis (anglais) - [30h Travaux dirigés] Q110-[+]5
INFO0955-1Bioinformatics applications: Case studies in veterinary sciences, agronomical sciences and systems medicine (anglais) - [50h Travaux dirigés] Q220-[+]8

Poursuite du choix du programme

En accord avec le Jury, poursuivre le programme choisi en fonction du parcours de l'étudiant :

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits

Programme réformé

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
BIOL0030-1Modeling dynamical biological systems (anglais) - [15h Travaux dirigés] Q115-[+]3
BIOC9239-1Structural bioinformatics (anglais) Q12015-3
SMEM0023-1Mémoire
Collégialité
TA---24

Ancien programme

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
BIOL0030-1Modeling dynamical biological systems (anglais) - [15h Travaux dirigés] Q115-[+]3
BIOC9239-1Structural bioinformatics (anglais) Q12015-3
SMEM0023-1Mémoire
Collégialité
TA---24

Bloc d'aménagement du programme de l'année

Crédits supplémentaires (0-60 max) Master en bioinformatique et modélisation (120 ECTS)

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits

En accord avec le Jury et en fonction de leur formation antérieure, les étudiants suivront :

- soit le programme du Bloc 0 du Master en Biochimie et biologie moléculaire et cellulaire, à finalité

- soit un programme de 60 crédits maximum, les cours étant sélectionnés parmi les cours du Bachelier en sciences biologiques.

Cours au choix

Choisir des cours pour un total de 60 crédits parmi :

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
STAT0750-1Analyse statistique multivariée (logiciel R) Q21010-3
STAT0077-1Traitement et analyse informatiques de données biologiques Q125--2
MICR0720-1Phycologie et mycologie Q12010-3
MICR0721-1Bactériologie Q12010-3
MICR1716-1Virologie Q220--2
BIOL0216-1Physiologie animale
Q16030-7
BIOL0217-1Physiologie végétaleQ2   5
Théorie  35-- 
Pratique  -20- 
IMMU0521-1Immunologie Q22520-3
BIOL0868-1Biologie des organismes pluricellulaires animaux
N...
Q11515-3
BIOL0869-1Biologie des organismes pluricellulaires végétaux Q11515-3
GENE9002-1Biologie moléculaire du gène I Q130--3
GENE9003-1Biologie moléculaire du gène II - [1j Stages] Q23030[+]6
BIOC9242-2Chimie des macromolécules biologiquesQ1   4
Partim A  40-- 
Partim B - Thermodynamique des systèmes biologiques  10-- 
BIOC9243-1Equilibres en biochimie et cinétique enzymatique Q22040-5
BIOL0024-1Physiologie moléculaire de la cellule Q21515-2
PHIL1227-1Philosophie et bioéthiqueQ2   2
Eléments de philosophie des sciences
N...
 15-- 
Bioéthique  15-- 
LANG0077-8Anglais 2 (anglais) Q124--2
AESS0320-1Initiation à la didactique de la biologie Q22020-2

[...] les cours du Bachelier en sciences biologiques.-

Cours de mise à niveau dans le cadre du programme aménagé destiné aux étudiants qui bénéficient d'un accès direct en bloc 2

CodeDétailsOrganisationThéoriePratiqueAutresCrédits
En accord avec le Jury, l'étudiant suivra, si nécessaire, des cours de mise à niveau pour maximum 8 crédits sélectionnés parmi les cours ci-dessous en fonction de sa formation antérieure.
BIOC0726-1Boîte à Outils : Techniques d'analyse des acides nucléiques - [4h Autres] Q12412[+]3
OCEA0224-1Analyse statistique des données océanographiques Q11515-3
INFO0960-1Command-line interfaces and tools for biologists (anglais) Q21010-2