Durée
10h Th, 20h TD
Nombre de crédits
| Master en bioinformatique et modélisation, à finalité approfondie | 3 crédits |
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Ce cours enseigne la création et l'usage de bases de données relationnelles, dans le contexte des applications bioinformatiques.
Bases de données & SQL
1. Les données : concepts généraux et intérêts de les structurer
2. Modéliser une base de données
- Le modèle Entité-Association
- Le modèle relationnel
- La normalisation
- Génération d'un schéma relationnel
- Du modèle à la structure physique, le Data Definition Language (DDL)
- Manipulation et interrogation de la base de données, le Data Modification Language (DML)
- Requêtes simples
- Requêtes complexes
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Ce cours vise à ce que les étudiants soient capables d'appréhender, d'organiser et d'interroger des données complexes et massives. A l'issue de ce cours, les étudiants auront acquis les bases leur permettant de concevoir des bases de données relationnelles et d'écrire les requêtes en langage SQL permettant de manipuler ces bases de données et d'en extraire les informations.
Savoirs et compétences prérequis
Ce cours ne suppose aucune connaissance particulière en informatique, mais il s'appuie néanmoins sur l'introduction à l'environnement Linux et à la ligne de commande [INFO0960] du Master BBMC et Master BIM.
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
- mini-exposés théoriques
- défis à résoudre
- travaux pratiques sur ordinateur
- autoformation (manuels et tutoriels en ligne)
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
Ce cours est essentiellement en présentiel, mais son approche par problèmes nécessitera du travail en dehors de la salle de classe.
Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées
Plate-forme(s) utilisée(s) pour les supports de cours :
- eCampus
Modalités d'évaluation et critères
Examen(s) en session
Toutes sessions confondues
- En présentiel
évaluation écrite ( questions ouvertes )
Informations complémentaires:
L'évaluation consistera en la réalisation d'un problème intégratif. L'examen se déroulera à livre ouvert.
Stage(s)
Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours
ATTENTION : Chaque étudiant de M-BIM doit se munir d'un ordinateur portable sur lequel il doit être possible d'installer un système Linux (type Ubuntu LTS). Les machines virtuelles interactives dans VirtualBox ne sont pas une solution fiable, mais WSL2 sur un Windows récent est envisageable, de même qu'un dual-boot avec Windows.
https://ubuntu.com/tutorials/install-ubuntu-on-wsl2-on-windows-11-with-gui-support
Contacts
Dr. Pierre Tocquin
Institut de Botanique B22 (P70)
ptocquin@uliege.be