2024-2025 / SDOC0061-1

Outils moléculaires pour la systématique et l'écologie bactériennes

Durée

15h Th

Nombre de crédits

 Formation doctorale en sciences (BBMC)3 crédits 

Enseignant

Annick Wilmotte

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement durant l'année complète, avec partiel en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Depuis une vingtaine d'années, il est apparu que l'étude de la diversité des microorganismes marins ne peut se faire sans une approche moléculaire, étant donné que seule une fraction d'entre eux peut être isolée en culture. De plus, pour les microorganismes observables en microscopie, la diversité génétique est plus grande que celle déterminée sur base des caractères phénotypiques (morphologie...). La détermination de la diversité au niveau génétique permet aussi de comprendre des caractéristiques écologiques (distribution géographique, endémisme, etc.).

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Donner aux étudiants les connaissances leur permettant, d'une part de comprendre et lire de manière critique la littérature concernant la diversité des microorganismes marins, et d'autre part, d'utiliser les techniques moléculaires pour résoudre les problèmes de diversité et d'écologie moléculaire sur lesquels ils travaillent (mémoire, doctorat, etc).

Savoirs et compétences prérequis

Avoir une base de connaissances concernant le matériel génétique, ADN, ARN, protéines. Si ce prérequis est absent, un cours peut être consacré à une mise à niveau.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

Possibilité de démonstrations au laboratoire

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Enseignement présentiel, au 1er ou 2nd quadrimestre 1) Définitions 2) Pourquoi ? 3) Marqueurs moléculaires de diversité 4) Techniques moléculaires 5) Analyses phylogénétiques 6) Comment est générée la diversité génétique? 7) Examples d'applications en écologie microbienne moléculaire 8) Si l'étudiant(e) est intéressé, possibilité de démonstrations avec extraction d'ADN génomique de souches, PCR, électrophorèse, séquençage, analyse des séquences obtenues

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Il s'agit d'une copie des transparents montrés

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation orale


Explications complémentaires:

2) Examen théorique ou présentation d'article

Stage(s)

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Cours à option

Contacts

A. Wilmotte, InBios, Chimie B6,
Tél. : 04/366.33.87/38.56,
e-mail : awilmotte@ulg.ac.be

Association d'un ou plusieurs MOOCs