2024-2025 / VDOC0039-1

Introduction à la génomique

Durée

20h Th

Nombre de crédits

 Formation doctorale en sciences vétérinaires3 crédits 

Enseignant

N...

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Le cours de Génomique vise à initier les étudiants aux notions de base de génomique, en insistant sur les spécificités du génome humain.

Il comprend 5 chapitres consacrés respectivement à (i) le génome humain de référence, (ii) les génomes individuels, (iii) les phénomes individuels, (iv) les méthodes d'analyse des circuits fonctionnels, et (v) la génomique médicale.
 
La table des matières peut être consultée via le lien ci-dessous :

https://www.gigauag.uliege.be/cms/c_4766333/en/gigauag-teaching

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

A l'issue du cours, les étudiants devraient avoir acquis une compréhension de base correcte de l'anatomie du génome humain, des méthodes de séquençage modernes, des méthodes d'annotation du génome, de la notion de polymorphismes génétiques et des principaux types de polymorphismes existants, des facteurs qui déterminent le degré de polymorphisme observé dans une population, de l'inférence que l'on peut faire quant à l'histoire de l'humanité sur base de l'analyse du polymorphisme, de la notion de déséquilibre de liaison et de bloc haplotypique, des principaux projets collaboratifs internationaux en matière de génomique humaine, de la notion de variants génétiques neutres vs fonctionnels et somatiques vs germinaux, de l'architecture génétique de maladies monogéniques, de l'architecture génétique de pathologies complexes courantes, du rôle des variants génétiques somatiques et germinaux dans le déterminisme du cancer, d des méthodes de génétique forward et inverse pour la dissection des circuits fonctionnels et des applications principales de la génomique médicale.

Savoirs et compétences prérequis

Notions de base de biologie moléculaire du gène, de calcul de probabilité et de statistiques.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

La matière est définie par le contenu des notes de cours qui sont disponibles sur le site eCampus ainsi que le site du laboratoire UAG au GIGA.  Les notes de cours seront actualisées pour chaque cours.  Des diapositives (ppt) avec audio en français sont également mises à la disposition des étudiants sur les mêmes sites.  Elles sont également actualisées pour chaque cours.  Les étudiants sont invités à lire les notes de cours et étudier les diapositives avant chaque cours (un demi chapitre par cours, 10 cours de 2 heures).  Les cours, qu'ils soient en présentiel ou par vidéo (en fonction des conditions covid) servent à discuter de la matière correspondante sur base de questions posées par les étudiants sur base de leurs préparations.

 

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

La matière est définie par le contenu des notes de cours qui sont disponibles sur le site eCampus ainsi que le site du laboratoire UAG au GIGA.  Les notes de cours seront actualisées pour chaque cours.  Des diapositives (ppt) avec audio en français sont également mises à la disposition des étudiants sur les mêmes sites.  Elles sont également actualisées pour chaque cours.  Les étudiants sont invités à lire les notes de cours et étudier les diapositives avant chaque cours (un demi chapitre par cours, 10 cours de 2 heures).  Les cours, qu'ils soient en présentiel ou par vidéo (en fonction des conditions covid) servent à discuter de la matière correspondante sur base de questions posées par les étudiants sur base de leurs préparations.

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Notes de cours (Essential Human Genomics, Michel Georges) accompagnées des diaporamas utilisés lors des cours.
https://www.gigauag.uliege.be/cms/c_4766333/en/gigauag-teaching

Modalités d'évaluation et critères

L'examen est un examen de type QCM qui se fera soit en présentiel soit à distance en fonction des conditions COVID du moment.

Stage(s)

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Contacts

Michel Georges michel.georges@uliege.be

 
 

Association d'un ou plusieurs MOOCs