2024-2025 / GBIO0034-1

Neuroimaging data analysis

Durée

10h Th, 5h Pr

Nombre de crédits

 Master : ingénieur civil biomédical, à finalité spécialisée2 crédits 

Enseignant

Christophe Phillips

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue anglaise

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Technique de traitement et d'analyse d'images médicale, principalement orienté vers le traitement spatial et l'analyse statistique en neuro-imagerie fonctionnelle et structurelle.

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

Avoir une vue d'ensemble sur les étapes du traitement d'images, principalement en neuro-imagerie fonctionnelle et strucutrelle:

  • prétraitement spatial des images: réalignement, normalisation, coregistration, segmentation
  • modélisation statique à l'aide du "Modèle Lnéaire Générale" et estimation des paramètres
  • inférence statistique sur ces paramètres et correction pour le problème de comparaisons multiples
  • méthodes annexes: statistique non-paramétrique, connectivité, modèle causal dynamique, inférence Bayesienne, etc.
Ce cours contribue aux acquis d'apprentissage I.2, II.1, II.2, II.3, III.2, IV.1, IV.2, VI.1, VI.2, VI.3, VII.3, VII.4, VII.5 du programme d'ingénieur civil en génie biomédical.

Savoirs et compétences prérequis

Notions de traitement du signal et d'images et/ou expérience en imagerie médicale et/ou en analyse statistique.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

  • exposé ex cathedra de la matière principale
  • démonstration pratique des outils d'analyses sur des données réelles
  • exercices personnel à réaliser sur des données réelles

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Cours donné exclusivement en présentiel


Explications complémentaires:

Cours donné en présentiel.

Des vidéos et notes de cours, donnés à l'ULiège ou au University College Londron, sont disponibles:

 

Supports de cours, lectures obligatoires ou recommandées

Autre(s) site(s) utilisé(s) pour les supports de cours
- GIGA Indico (https://indico.giga.uliege.be/event/546/)


Informations complémentaires:

Les notes de cours d'années précédentes sont disponibles ne ligne (2020, 2021, 2022 et 2023) ainsi que les notes des cours SPM officiels organisés au University College London.

Les notes et informations du cours de cette année (2024) seront disponibles sur cette page Indico.

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation orale


Explications complémentaires:

Pour les étudiants en Master en sciences appliquées, physique ou autres, il s'agira de présenter, en se focalisant sur les aspects méthodologiques, et discuter oralement en 20-30 minutes un article scientifique récent (et de son choix) en rapport avec le cour (neuroimagerie, appllication clinique, méthode d'analyse, etc.). Cette présentation aura lieu en présentiel et se fera devant les autres étudiants.

Pour les étudiants réalisant un projet au CRC (stage ou thèse de doctorat), le projet réalisé en neuro-imagerie sous la supervision d'un chercheur permanent du CRC servira d'évaluation: compréhension des techniques utilisées, capacités à traiter les données indépendemment et à interpréter les résultats.

La date et l'heure de l'examen, en janvier ou février, sont à fixer en accord avec les étudiants.

 

Stage(s)

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Le cours se donne en anglais.

Il s'agit d'une réorganisation du cours STAT0722-1 " Introduction à la statistique médicale", organisé en Faculté des Sciences jusqu'à l'année académique 2022-2023.

Contacts

Christophe Phillips, c.phillips@uliege.be

Association d'un ou plusieurs MOOCs