Durée
12h Th, 8h Pr
Nombre de crédits
| Master en sciences biomédicales, à finalité | 2 crédits |
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au deuxième quadrimestre
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Les avancées en méthodologie morphologique, intitulé de ce cours, reprennent les technologies de cytométrie en flux et d'imagerie cellulaire, au sens large.
La cytométrie en flux est une discipline permettant l'étude rapide et précise de particules monodispersées après marquage par des sondes fluorescentes spécifiques de molécules très diversifiées (antigènes membranaires, cytokines, acides nucléiques, récepteurs viraux, ions calcium etc...). Cette technologie, qui est notamment utilisée dans le diagnostic des leucémies et le phénotypage complexe des lignées lymphoïdes, devient incontournable dans de nombreux thèmes de recherches en sciences biomédicales.
L'imagerie cellulaire in vitro regroupe quant à elle de nombreuses technologies d'acquisitions d'images morphologiques (tissulaires, cellulaires et sub- cellulaires) et est aussi largement utilisée dans la recherche en sciences biomédicales pour mieux comprendre de nombreux processus biologiques.
Ces deux disciplines se rejoignent inévitablement par l'utilisation de sondes fluorescentes, dont l'excitation et la détection sont possibles grâce à des éléments optiques et électroniques comparables. Il est donc tout à fait judicieux de les enseigner concomitamment.
La première partie du cours, intitulée « Introduction générale », reprendra les bases optiques et électroniques applicables à la fois à la cytométrie en flux et à l'imagerie cellulaire, en général:
- La fluorescence
- Les caractéristiques des fluorochromes
- Les filtres optiques de fluorescence
- Les sources lumineuses
- La digitalisation du signal lumineux par photomultiplication
- Le chevauchement spectral
Ensuite, les spécificités propres à chacune des disciplines seront enseignées plus en détails:
La cytométrie en flux:
- Fondement et principes de la cytométrie en flux
- Principes techniques
- Interprétation des résultats
- Notions de compensations électroniques
- Principales applications
- Le tri cellulaire
- Introduction à différents logiciels d'analyse multiparamétriques en cytométrie en flux
- Avancées technologiques
L'imagerie cellulaire:
- Généralités d'optique
- Les principaux composants du microscope
- Microscopie en lumière blanche
- Microscopie de fluorescence
- Microscopie confocale
- Microscopie confocale multiphotonique
- Microscopie à feuille de lumière
- Augmentation du pouvoir de résolution
- Analyse et traitement d'images
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Ce cours permettra aux étudiants d'avoir de bonnes bases en méthodologie morphologique afin d'aborder la suite de leur cursus et leur future carrière professionnelle en ayant connaissance de l'étendue des outils technologiques en méthodologie morphologique mis à leur disposition pour mener à bien leurs recherches biomédicales.
A l'issue du cours, les étudiants seront capables de :
- Choisir la meilleure méthodologie morphologique pour répondre à une question biologique.
- Comprendre l'importance des avancées technologiques dans ces disciplines et en tirer le meilleur profit.
- Connaître les avantages et les limitations des technologies de cytométrie en flux et d'imagerie cellulaire.
- Réaliser l'importance de l'analyse des résultats générés par ces disciplines et en reconnaître les éventuels artéfacts.
- Avoir les meilleures bases possibles pour aborder une formation sur un instrument relevant de ces technologies.
Savoirs et compétences prérequis
pas de prérequis
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Le cours théorique sera donné, en français, durant 12 heures soutenues par de nombreuses diapositives en anglais. La partie travaux pratiques sera dispensée (en français et/ou en anglais) durant 8 heures (par groupe de 8 étudiants maximum) au sein de la plateforme GIGA d'Imagerie Cellulaire et de Cytométrie en flux. Cette dernière dispose de plus de 20 instruments en la matière, dont certains de la toute dernière génération. Le personnel technique de la plateforme, hautement qualifié dans ces technologies, sera impliqué lors des démonstrations de certains équipements et mettra en œuvre diverses applications afin d'éveiller la curiosité et l'intérêt des étudiants.
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
Cours donné exclusivement en présentiel
Explications complémentaires:
Hybride ou à distance en fonction des conditions sanitaires.
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Pas de lecture recommandée ou obligatoire. Les notes de cours à la disposition des étudiants seront constituées d'un PDF des diapositives. Pas de syllabus, les étudiants devront prendre note durant le cours.
Modalités d'évaluation et critères
Examen(s) en session
Toutes sessions confondues
- En présentiel
évaluation orale
Interrogation(s) hors session
Explications complémentaires:
Une interrogation écrite comptant pour 15% de la côte finale aura lieu avant la séance de travaux pratiques. L'examen final oral, comptant pour 85% de la côte finale, aura lieu à livre fermé.
Stage(s)
sans objet
Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours
Les cours se donnent oralement en français mais les diapositives seront en anglais. Les examens oraux peuvent être présentés en français ou en anglais.
Contacts
Sandra Ormenese, PhD E-mail: Sandra.Ormenese@uliege.be Tél: 04/366.49.38