2023-2024 / GENE0431-1

Compléments de génomique

Durée

20h Th

Nombre de crédits

 Master en sciences biomédicales, à finalité2 crédits 

Enseignant

Michel Georges

Langue(s) de l'unité d'enseignement

Langue française

Organisation et évaluation

Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier

Horaire

Horaire en ligne

Unités d'enseignement prérequises et corequises

Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme

Contenus de l'unité d'enseignement

Le cours  est une introduction générale à la génomique médicale humaine.

Il comprend les cinq chapitres suivants:

1. Le génome humain de référence

2. Génomes individuels

3. Phénomes individuels

4. Dissection génétique des circuits fonctionnels

5. Génomique médicale appliquée

Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement

A l'issue du cours, les étudiants seront familiarisés avec:

  • L'organisation et les principales caractéristiques du génome humain, les techniques de séquençage et d'annotation du génome.
  • Des notions de base de la génomique des population et évolutive, en cela compris les types de variants génétiques, les origines du polymorphisme, le déséquilibre de liaison et les blocs haplotypiques, les méthodes de génotypage, la reconstruction de notre histoire évolutive, et les signatures de sélection.
  • Des notions de base de génétique factorielle et quantitative, en cela compris la distinction entre caractères mono-, oligo- et polygéniques, les bases moléculaires de la dominance et de la récessivité, l'épistasie, les coefficients de parenté et la consanguinité, l'héritabilité et ses méthodes de calculs, la différénce entre les effets génétiques dirtects et indirects, et la corrélation génétique. 
  • La contribution de variants germinaux et somatiques dans le déterminisme des cancers.
  • Les principales techniques de génétique forward et reverse pour l'identification de variants et gènes causaux, en cela compris le clonage positionnel, ainsi que l'ontologie de gène et la traçage de lignées cellulaires.
  • Les principales applications médicales de la génomique humaine dont le diagnostic de proteurs précon ceptionnel, le diagnoctios préimplantatoire et prénatal, la génomique pédiatrique, la pharmacogénomique, les scores de risque polygéniques, et le profilage génomique des cancers.    

Savoirs et compétences prérequis

Notions de base de biologie moléculaire du gène, de calcul de probabilité et de statistiques.

Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement

The cours comprend dix sessions de 2 heures pour un total de 20 heures de cours en présentiel.  Chaque session de 2 heures est consacrée à un demi chapitre.   Les étudiants doivent préparer les sessions en lisant les partie correspondantes des notes de cours.  Celles-ci sont téléchargeables soit à partir du site de l'UGA soit sur eCampus.  Les étudiants formulent des questions sur base de leurs lectures et les communiquent à l'enseignant soit avant (en utilisant la plateforme de discussion eCampus), soit pendant le cours.  Le cours en présentiel est elaboré en temps réel sur base des questions des étudiants.    

 

Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)

Cours donné exclusivement en présentiel

Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours

Note de cours et présentations powerpoint téléchargeables à partiur du site web de l'UGA ou d'eCampus.

Modalités d'évaluation et critères

Examen(s) en session

Toutes sessions confondues

- En présentiel

évaluation écrite ( QCM )

Stage(s)

Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours

Contacts

Michel Georges : michel.georges@uliege.be

Caroline Hupperts: chupperts@uliege.be


Miyako Sakai : miyako.sakai@uliege.be

Association d'un ou plusieurs MOOCs

Aucun MOOC n'est associé à ce cours.