Durée
26h Th, 26h Pr
Nombre de crédits
| Master : ingénieur civil biomédical, à finalité | 5 crédits |
Enseignant
Langue(s) de l'unité d'enseignement
Langue anglaise
Organisation et évaluation
Enseignement au deuxième quadrimestre
Horaire
Unités d'enseignement prérequises et corequises
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement
Ce cours couvrira une introduction à la biologie systémique et synthétique.
La partie de l'introduction à la biologie systémique traitera en particulier l'émergence de propriétés de systèmes dynamiques biologiques telle que la robustesse, la performance, la complexité et l'optimalité.
Les thématiques de la partie théorique sur la biologie synthetique
sont :
- historique de la biologie synthétique
- outils et approches de la biologie synthétique
- séquençages ADN, fabrication d'ADN (« briques élémentaires »)
- modélisation mathématique
- mesures (microscopie, cryométrie de flux)
- Design de voies métabolique « sur-mesure »
- Design de systèmes de régulation
- Sécurité, aspects sociales et éthiques
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement
Au terme du cours, l'étudiant maîtrisera les concepts de base de la biologie synthétique. Il sera capable de synthétiser virtuellement ainsi que dans E. coli de simples systèmes synthétiques.
L'utilisation de l'anglais comme langue de cours et de support de cours permet aux étudiants de développer leur compréhension à l'écoute et à la lecture de l'anglais scientifique et technique.
Ce cours contribue aux acquis d'apprentissage II.1, II.2, III.1, III.3, IV.1, V.2, VI.2, VII.5, VII.6 du programme d'ingénieur civil en génie biomédical.
Savoirs et compétences prérequis
aucun
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement
Le cours repose sur des exposés ex-cathedra ainsi que d'un projet de laboratoire, qui nécessitera l'utilisation d'un ordinateur pour simuler des systèmes de réactions biochimique (Matlab ou un programme de simulation de biologie systémique), ainsi que des manipulations biologique / biochimique.
Le cours est enseigné en anglais. Cependant, les étudiants peuvent poser des questions en anglais ou en français.
Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride)
présentiel
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours
Ouvrage de référence pour la biologie systémique : Uri Alon « An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits », Chapman & Hall/CRC Mathematical & Computational Biology, 1996.
Modalités d'évaluation et critères
Examen(s) en session
Toutes sessions confondues
- En présentiel
évaluation orale
Explications complémentaires:
Rapport détaillé individuel (style publication) sur le projet, (25%) ; examen oral (75%).
La participation aux travaux pratiques (projet) est un prérequis pour l'accès à l'examen final. La cote du projet est valable un an.
Stage(s)
Remarques organisationnelles et modifications principales apportées au cours
Le cours est organisé au 2eme quadrimestre à des dates à convenir.
Contacts
Frank DELVIGNE
Gembloux Agro-Bio Tech
Microcial Processes and Interactions
Avenue de la Faculté 2B
5030 Gembloux
Tel 081 622309
F.Delvigne@uliege.be